Ergenekon soruşturmasını yürüten savcılar, Deniz Kuvvetleri Komutanlığı tarafından Koç Müzesi'ne devredilen Ali Uluç Reis isimli denizaltıda bulunan ve daha sonra imha edilen TNT kalıpları, saniyeli fitil, mekanik fünyeden oluştuğu belirtilen mühimmat ile ilgili olarak Genelkurmay Askeri Savcılığı'na yazı göndererek bilgi talep etti.

Genelkurmay Başkanlığı cevap yazısında TNT kalıpları ve saniyeli fitilden oluşan tahrip kalıplarının kadrolu ordu donatım malzemesi olarak denizaltı gemilerine tahsis edildiğini belirtip, '2002'den itibaren güvenlik mülahazaları ile bahse konu malzemelerin sadece gerginlik ve muhasamat (düşmanlık) dönemlerinde seyir öncesinde teldim alınması ve müteakiben seyir hitamında iade edilmesi yöntemiyle kullanılmak üzere sahildeki ordonat depolarında muhafaza edilmeye başlanmıştır' denildi.

Yazıda ayrıca, 'Bahse konu denizaltıda görev gereği bulundurulmuş olan mühimmat diğer tüm kullanılabilir kullanılmaz malzemelerde olduğu gibi sayılarak teslim edilmiş ve yapılan mühimmat sayımında herhangi bir eksiklik tespit edilmemiştir' denildi.

Yazıda, hizmet dışına ayrılmış bir gemide bu tip malzemelerin bulunması veya bulundurulmasının mümkün olmadığı belirtildi. Yazıda ayrıca, 'Patlayıcıların denizaltıya nasıl girdiğine ilişkin herhangi bir veri bulunmamaktadır' denildi.