Ümraniye soruşturmasında, eski Astsubay Oktay Yıldırım, emekli Yüzbaşı Muzaffer Tekin, işadamı Kuddisi Okkır ve yazar Ergun Poyraz'ın da aralarında bulunduğu 13 kişi tutuklanmıştı.

Soruşturma sırasında astsubay Oktay Yıldırım'ın evinde ele geçirilen bilgisayarlarda, polisin iddialarına göre 'Ergenekon' adlı bir yapılanmanın ipuçları ve örgüt manifestosu bulundu.

Bunun üzerine soruşturmayı yürüten İstanbul Cumhuriyet Savcısı Zekeriya Öztürk, operasyonun genişletilmesi için düğmeye bastı. Organize Suçlarla Mücadele ve İstihbarat Şube Müdürlüğü ekipleri, özellikle Mersin'de silah üzerine 'ölme-öldürme yemini' ettiren Kuvayı Milliye Derneği Başkanı emekli Albay Fikri Karadağ ve emekli Tuğgeneral Veli Küçük etrafındaki ilişki ağını izlemeye başladı. Telefon dinlemeleri, görüntü ve dinleme sistemli araçlarla yapılan takipler sonunda, dernek çatısı altında ölüm listeleri ve suikast timleri hazırlandığı saptandı.

Vatan gazetesinin iddiasına göre, örgütün bir tetikçiye şifreli bir liste vermesi üzerine düğmeye basıldı.Yaklaşık 1,5 ay önce telefon görüşmelerine yansıyan suikast planları üzerine, İstanbul Polisi alarma geçti. İddiaya göre örgütün hedefinde 6 isim vardı. Bunlar, DTP'li milletvekilleri Ahmet Türk, Sebahat Tuncel, Diyarbakır Belediye Başkanı Osman Baydemir, eski DEP'li Leyla Zana, Nobel ödüllü yazar Orhan Pamuk ve Gazeteci Fehmi Koru'ydu.