Ahmet Altan, İpek Koza Holding'e yapılan operasyonun ardından 2 Eylül'de, Samanyolu Haber kanalında bir programa katıldı. Cumhurbaşkanı Erdoğan ve AK Parti hakkında skandal açıklamalarda bulunan Altan, Erdoğan'ın Anayasa'yı çiğnediğini savundu.
Erdoğan'ın avukatlarının şikayeti üzerine harekete geçen Ankara Cumhuriyet Başsavcılığı, Altan hakkında'Cumhurbaşkanı'na, hükümete, kamu görevlilerine hakaret ve halkı kin ve düşmanlığa sevk etmek' iddiasıyla soruşturma başlattı.