HSYK tarafından görevden alınan İzmir Cumhuriyet Savcısı Hüseyin Baş'ın yerine atanan Mustafa Doğru, ilk olarak Adalet Bakanlığı Müsteşarı Kenan İpek'in görevden alınmasını istediği, TCDD İzmir Liman İşletmesi'ndeki operasyonun savcısı Ali Çelik'in görevini değiştirdi. İzmir Adliyesi’nden 100’den fazla savcının görev yerinin değiştirildiği öğrenildi.

HSYK tarafından ilk olarak, Örgütlü Suçlar Bürosu'nun başında bulunan Cumhuriyet Başsavcı Vekili Ali Haydar, daha sonra da kendisine telefon eden Müsteşar İpek'in sözlerini tutanakla kayıt altına alan Cumhuriyet Başsavcısı Hüseyin Baş görevden alınmıştı. İzmir Adliyesi'nde son olarak, söz konusu operasyonunu düzenleyen Örgütlü Suçlar Bürosu'nda değişiklik yapıldı. 

Cumhuriyet Başsavcısı Mustafa Doğru, Adalet Bakanı Bekir Bozdağ hakkında fezleke hazırlanmasına sebep olan ve Müsteşar İpek'in görevden alınmasını istediği Savcı Çelik'in de bulunduğu Örgütlü Suçlar Bürosu'nda görevli bütün savcıları görevden aldı. 

Bunlar arasında, İzmir Büyükşehir Belediyesi'ne yönelik yolsuzluk operasyonu davasının soruşturma savcısı olan Birol Çengil'in de olduğu öğrenildi.

Görevi değiştirilen liman soruşturması savcısı Ali Çelik, 6. Asliye Ceza Mahkemesi'nde duruşma savcısı yapıldı. Çengil ise, 14. Asliye Ceza Mahkemesi'nde ve Genel Soruşturma Bürosu'nda görevlendirildi. Örgütlü Suçlar Bürosu’nun diğer savcıları da Genel Soruşturma Bürosu'na kaydırıldı. Bu savcılardan boşalan Örgütlü Suçlar Bürosu'na Ahmet Türkoğlu, Mehmet Alyaprak, Cevat Mert Koparal ve İsmail Arslan getirildi. 

İzmir Cumhuriyet Başsavcısı Doğru’nun talimatıyla Sahtecilik ve Dolandırıcılık Bilişim Suçları Bürosu'nu kapatılarak buranın göreviyle ilgili sorumluklar Genel Soruşturma Bürosu'na bağlandı.